107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2746 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 461 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.33 
 
 		 374 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.47 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.37 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  29.84 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  31.76 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  27.24 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  26.46 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  31.52 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  26.35 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  26.67 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  30.72 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  28.24 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  26.67 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  29.1 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  30.38 
 
 		 314 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  26.01 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  25.68 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  27.52 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  27.95 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  26.76 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  24.14 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  22.44 
 
 		 366 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 573 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1069 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 4079 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 366 aa  53.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.52 
 
 		 1979 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.77 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  38.46 
 
 		 784 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  27.61 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  31.21 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  26.98 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 639 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  31.21 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.74 
 
 		 1056 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  27.7 
 
 		 308 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  31.76 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  32.43 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 880 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 612 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.25 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.11 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 636 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 611 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 715 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.11 
 
 		 581 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  27.52 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3954  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.06 
 
 		 970 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 		 810 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 224 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 626 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 614 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 614 aa  47.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 626 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1104 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 615 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 374 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3867  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.67 
 
 		 967 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0550  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.05 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 105 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  24.79 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  32.63 
 
 		 715 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.96 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 3560 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 3035 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  47.27 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 2262 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  26.35 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 762 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 827 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.73 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3309  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2808  hypothetical protein  28.91 
 
 		 304 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336763  normal  0.317543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 927 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 620 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.25 
 
 		 638 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.25 
 
 		 637 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 638 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>