27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4831 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  87.13 
 
 
331 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  86.31 
 
 
333 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  57.59 
 
 
328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  53.94 
 
 
314 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  54.69 
 
 
307 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  53.72 
 
 
314 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  53.4 
 
 
314 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  47.88 
 
 
316 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  47.62 
 
 
316 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  51.97 
 
 
297 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  40.99 
 
 
346 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  40.68 
 
 
346 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  41.3 
 
 
349 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  39.35 
 
 
319 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  28.1 
 
 
457 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 
461 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.51 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.47 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  24.11 
 
 
719 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  23.28 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  23.5 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  24 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.89 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  24.4 
 
 
399 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  25.77 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>