36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2137 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  81.01 
 
 		 316 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  51.49 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  49.84 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  51.16 
 
 		 349 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  51.13 
 
 		 308 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  48.87 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  48.39 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  48.55 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  47.88 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  50.34 
 
 		 307 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  46.91 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  45.78 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  45.63 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  45.13 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  40.6 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25.91 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 461 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.96 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.59 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.96 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.28 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28.26 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.84 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  25.81 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  21.62 
 
 		 517 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.43 
 
 		 391 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.05 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  21.62 
 
 		 517 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  25.56 
 
 		 516 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.35 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  20.33 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.42 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  27.36 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  30 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>