40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1034 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  100 
 
 		 383 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  36.39 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  33.02 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  32.39 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  32.11 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.91 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.06 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.52 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  29.79 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.02 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  30 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.78 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  31.75 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  31.39 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  31.75 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  28.32 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  28.67 
 
 		 479 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  30.77 
 
 		 474 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  30.77 
 
 		 474 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  30 
 
 		 476 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  28.87 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  34.75 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  30.77 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  34.84 
 
 		 337 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  28.85 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  27.64 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0881  hypothetical protein  84.09 
 
 		 92 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  23.61 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  26.13 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  23.28 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  26.12 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  25.17 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  27.88 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  24.84 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  21.11 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  30.94 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1672  hypothetical protein  24.37 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.42 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>