45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2128 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  98.07 
 
 
517 aa  1044    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1064    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  28.66 
 
 
375 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  23.7 
 
 
366 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.22 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  29.28 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.42 
 
 
361 aa  77  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  23.03 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  24.42 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  22.92 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  22.92 
 
 
385 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  22.63 
 
 
385 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.42 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  25.73 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  22.69 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.67 
 
 
391 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.77 
 
 
366 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  22.17 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  22.93 
 
 
372 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.61 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  22.75 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21.94 
 
 
366 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  24.48 
 
 
429 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  22.89 
 
 
388 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  21.62 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  23.32 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  23.5 
 
 
360 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  19.34 
 
 
346 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5558  hypothetical protein  25.61 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  20.9 
 
 
349 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.11 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  19.34 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  24.28 
 
 
368 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  27.36 
 
 
1349 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  23.67 
 
 
337 aa  45.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3432  hypothetical protein  37.78 
 
 
441 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  21.92 
 
 
457 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  23.49 
 
 
316 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>