30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2231 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  96.91 
 
 		 346 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  89.97 
 
 		 349 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  52.87 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  50.83 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  48.04 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  46.46 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  40.68 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  46.37 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  39.49 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  46.69 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  46.69 
 
 		 314 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  38.69 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  38.21 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  46.44 
 
 		 297 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  39.53 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.09 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.34 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  22.76 
 
 		 719 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.6 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  19.34 
 
 		 517 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.37 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  31.21 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  20.2 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  27.27 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  28.67 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  27.27 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>