28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4683 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  98.8 
 
 		 333 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  669    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  87.13 
 
 		 334 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  56.62 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  53.48 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  51.78 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  51.1 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  51.78 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  47.15 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  45.78 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  46.25 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  50.58 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  38.21 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  38.21 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  39.5 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  39.1 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.01 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.71 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  25.24 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  26.67 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  26.83 
 
 		 399 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.88 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  21.41 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  27.75 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>