25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3215 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  951    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  28.1 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  26.16 
 
 		 328 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  24.84 
 
 		 333 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  25.33 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  25.91 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  23.71 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  25.26 
 
 		 349 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  24.83 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  25.6 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  26.39 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  24.41 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  24.92 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  24.07 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  26.59 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.3 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.56 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.88 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  31.68 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.71 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  23.3 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  21.92 
 
 		 517 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  21.92 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>