53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2847 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  100 
 
 		 377 aa  774    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  54.13 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  29.53 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  30.93 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  28.07 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  29.28 
 
 		 517 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  27.91 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.43 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  27.51 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21.43 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  27.18 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  27.16 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  27.01 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  26.92 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  24.41 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  26.37 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  27.09 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  25.33 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  27.66 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.07 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  24.92 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  25 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  26.56 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  26.8 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  25.06 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  24.18 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.46 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.77 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  26.28 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  26.96 
 
 		 316 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  24 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  25.08 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  25.11 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  25.17 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  25.85 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.15 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  25.7 
 
 		 314 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  25.7 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  31.51 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  23.28 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  23.28 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  23.28 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  25.43 
 
 		 719 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  28.57 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  23.01 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  22.57 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  22.84 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  24.85 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  22.67 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  24.64 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  26.29 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>