31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1108 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  81.01 
 
 		 316 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  53.18 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  52.87 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  52.88 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  51.77 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  49.52 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  49.2 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  48.87 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  47.62 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  53.02 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  45.48 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  46.1 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  46.25 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  45.05 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  41.22 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25.33 
 
 		 457 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.49 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.69 
 
 		 719 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.96 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.81 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.27 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  24.06 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.9 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  29.93 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  22.61 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.08 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  25.81 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  23.49 
 
 		 517 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  25.71 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>