28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4314 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  675    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  98.8 
 
 		 331 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  86.31 
 
 		 334 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  56.62 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  53.94 
 
 		 307 aa  275  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  50.31 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  51.94 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  51.94 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  47.02 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  45.63 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  46.1 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  51.54 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  38.69 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  38.69 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  38.67 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  38.02 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  24.84 
 
 		 457 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.16 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.71 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.04 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  26 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  26 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  25.99 
 
 		 719 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  27.44 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.38 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  27.75 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  25.9 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>