29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2189 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  88.99 
 
 		 346 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  88.69 
 
 		 346 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  53.25 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  51.16 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  47.71 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  48.22 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  41.3 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  47.24 
 
 		 314 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  47.06 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  47.06 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  39.01 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  38.97 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  39.81 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  46.03 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  39.53 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25.26 
 
 		 457 aa  85.9  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.42 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  27.52 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.33 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  30.63 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.29 
 
 		 719 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.85 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  21.02 
 
 		 517 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  20.56 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  20.7 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  28.86 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  30.94 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  31.15 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>