54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5462 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  29.53 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.61 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.34 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  23.7 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  23.7 
 
 		 517 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  28.85 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  24.93 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  19.6 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  22.41 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  26.67 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  26.67 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  27.24 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  24.3 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  26.49 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  26.92 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.87 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.27 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  24.19 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  24.04 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  26.96 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.42 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  25.23 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  24 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  23.16 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.45 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  20.44 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  24.83 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  24.22 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  24.3 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  27.52 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.32 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  23.28 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  20.59 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  25.29 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.24 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  23.97 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  23.94 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  23.58 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  23.94 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  23.04 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  23.04 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  23.04 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  22.46 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  22.61 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  20.24 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  21.5 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  22.61 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  21.58 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  24.6 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  25.98 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  21.48 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>