31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4603 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  607  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  79.21 
 
 		 308 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  56.38 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  56.38 
 
 		 314 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  56.04 
 
 		 314 aa  318  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  54.69 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  53.77 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  53.31 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  54.45 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  53.02 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  51.68 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  47.32 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  49.19 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  49.19 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  48.59 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  41.61 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  26.26 
 
 		 457 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  23.16 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.42 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.42 
 
 		 461 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  34.86 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.62 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.85 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  25.26 
 
 		 719 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  36.84 
 
 		 391 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.5 
 
 		 391 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  30.26 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  25.85 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  34.59 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  27.01 
 
 		 388 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  28.41 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>