45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  100 
 
 		 388 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  58.25 
 
 		 385 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  57.82 
 
 		 385 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  57.82 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  58.31 
 
 		 391 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  58.89 
 
 		 385 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  60.82 
 
 		 391 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  56.25 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  60.11 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  56.81 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  53.03 
 
 		 377 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  34.6 
 
 		 368 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  35.36 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  29.79 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  28.87 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  29.63 
 
 		 476 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  29.82 
 
 		 479 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  28.33 
 
 		 479 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  28.33 
 
 		 479 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  27.92 
 
 		 479 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  28.91 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  28.52 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  29.55 
 
 		 474 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  29.15 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  26.9 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  26.49 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  28.47 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  28.68 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.08 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  25.89 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  28.26 
 
 		 316 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  21.72 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  26.23 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  23.78 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.89 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  26.64 
 
 		 346 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.67 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  24.44 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  27.01 
 
 		 307 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 461 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  28.41 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  26.85 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>