29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0831 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  60.29 
 
 		 314 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  59.93 
 
 		 314 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  56.84 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  55.81 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  54.45 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  50.34 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  45.83 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  51.35 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  50.39 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  45.39 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  45.45 
 
 		 316 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  46.25 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  46.25 
 
 		 346 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  45.85 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  44.79 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  26.59 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.2 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  30.8 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  35.96 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.36 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  20.42 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  25.68 
 
 		 516 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.4 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  20.33 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.36 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.99 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.7 
 
 		 719 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2548  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0689469  normal  0.0687317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>