28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3552 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  57.59 
 
 
334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  56.62 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  56.62 
 
 
333 aa  352  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  45.48 
 
 
316 aa  255  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  46.91 
 
 
316 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  47.32 
 
 
307 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  44.86 
 
 
308 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  46.88 
 
 
314 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  39.63 
 
 
346 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  39.49 
 
 
346 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  46.84 
 
 
297 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  39.01 
 
 
349 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  35.35 
 
 
319 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  26.16 
 
 
457 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.18 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  31.21 
 
 
719 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  26.92 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  24.37 
 
 
366 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  24.37 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.96 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  23.23 
 
 
517 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.66 
 
 
390 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.58 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.66 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>