45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1494 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  720    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  93.99 
 
 		 366 aa  689    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  33.15 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  28.06 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  28.06 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  28.06 
 
 		 396 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  27.59 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  28.06 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  27.81 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  25.59 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  21.43 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  20.68 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3595  hypothetical protein  29.94 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000806669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.76 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  21 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  21.77 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  20.44 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3432  hypothetical protein  23.56 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  26 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.14 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5558  hypothetical protein  24.33 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  23.5 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1764  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  25 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  20.2 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  24.37 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  19.85 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  19.39 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  19.47 
 
 		 388 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  19.14 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  21.94 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  22.86 
 
 		 517 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  21.67 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  20.35 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  21.18 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  20.56 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  22.67 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  21.18 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  19.17 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  19.89 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  21.97 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  22.61 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  21.6 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  21.39 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>