46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4446 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  94.03 
 
 		 385 aa  752    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  94.03 
 
 		 385 aa  730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  99.22 
 
 		 388 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  67.71 
 
 		 391 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  66.15 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  59.69 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  57.82 
 
 		 388 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  55.32 
 
 		 391 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  55.84 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  53.66 
 
 		 377 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  35.82 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  31.7 
 
 		 476 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  29.23 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  30.28 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  29.97 
 
 		 479 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  28.83 
 
 		 474 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  28.43 
 
 		 479 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.58 
 
 		 360 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  27.85 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  28.47 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  28.93 
 
 		 479 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  30.18 
 
 		 479 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  29.82 
 
 		 479 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  28.21 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  28.52 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  29.67 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  22.82 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.92 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  32.34 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  29.95 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  28.62 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.59 
 
 		 361 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.08 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  29.39 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  19.85 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  31.65 
 
 		 319 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  19.85 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  25.74 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  26.87 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1436  hypothetical protein  31.73 
 
 		 752 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  22.35 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  21.58 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  23.21 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>