51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  100 
 
 		 391 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  96.68 
 
 		 391 aa  734    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  59.17 
 
 		 388 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  56.4 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  56.33 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  55.32 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  55.09 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  55.18 
 
 		 388 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  55.3 
 
 		 385 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  54.66 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  52.07 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  35.06 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  33.02 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  37.1 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  30.23 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  30.23 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  31.18 
 
 		 474 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  29.8 
 
 		 479 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  30.82 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  30.52 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  30.33 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  29.3 
 
 		 483 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  31.34 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  30.1 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  28.14 
 
 		 472 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  31.35 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  26.18 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  29.07 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  26.74 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.07 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  33.33 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.48 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  27.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  25.32 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  22.32 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  29.7 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.05 
 
 		 517 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  30.07 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  26.84 
 
 		 316 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  26.46 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.17 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  30.39 
 
 		 346 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.46 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  34.07 
 
 		 307 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  25.58 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  29.93 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  29.37 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21.97 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  22.26 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  28.86 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>