27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1904 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  880    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  26.37 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  26.37 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  25.85 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  25.59 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  25.87 
 
 		 483 aa  100  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  26.17 
 
 		 479 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  24.35 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  23.82 
 
 		 479 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  24.61 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  26.59 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  25.18 
 
 		 385 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.74 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  25.71 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  25.68 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  24.57 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  29.95 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  29.95 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.52 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  25.9 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.4 
 
 		 391 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  25.18 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  25.96 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  24.21 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  25.1 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  23.78 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  25.95 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>