29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1237 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  73.55 
 
 		 479 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  73.14 
 
 		 479 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  73.14 
 
 		 479 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  100 
 
 		 479 aa  1006    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  73.55 
 
 		 479 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  97.49 
 
 		 479 aa  951    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  81.2 
 
 		 483 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  60.49 
 
 		 476 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  58.57 
 
 		 483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  55.45 
 
 		 474 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  55.32 
 
 		 474 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  32.2 
 
 		 472 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.53 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.1 
 
 		 391 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.6 
 
 		 390 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.93 
 
 		 391 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  23.83 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  28.32 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  27.92 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.96 
 
 		 391 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  28.43 
 
 		 385 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  28.12 
 
 		 388 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  28.57 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  28.06 
 
 		 377 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  28.57 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  25.38 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  27.37 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  26.01 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  26.16 
 
 		 368 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>