37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1903 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  100 
 
 		 337 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  33.93 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  33.52 
 
 		 385 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  33.24 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  35.87 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  36.19 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  33.93 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  34.41 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.17 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.23 
 
 		 391 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  35.95 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  33.84 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  33.12 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  34.95 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  32.83 
 
 		 360 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  28.73 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  28.36 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  28 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  28.73 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  28.52 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  27.6 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  27.96 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  27.6 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  26.84 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  26.84 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  25.81 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  27.31 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.87 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.92 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  22.92 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  28.36 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  29.21 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  22.22 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  29.73 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  31.29 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  32.28 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  29.37 
 
 		 516 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>