29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  100 
 
 		 483 aa  1009    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  60.39 
 
 		 476 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  59.24 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  57.99 
 
 		 483 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  58.57 
 
 		 479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  57.85 
 
 		 479 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  56.99 
 
 		 479 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  57.2 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  55.58 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  49.67 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  49.89 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  32.05 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  31.34 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.93 
 
 		 391 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.87 
 
 		 436 aa  99.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  29.86 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.63 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28.91 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  27.85 
 
 		 385 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  27.85 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.85 
 
 		 385 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.4 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.55 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  30.77 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.85 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  24.72 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  29.71 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  26.86 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  24.55 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>