51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1054 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  94.88 
 
 		 391 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  100 
 
 		 391 aa  799    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  69.13 
 
 		 390 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  66.15 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  66.15 
 
 		 385 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  66.41 
 
 		 385 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  66.15 
 
 		 385 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  56.25 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  53.03 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  55.61 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  55.09 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  34.38 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  32.27 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  29.06 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  32.1 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  33.47 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  33.06 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  32.66 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  27.96 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  31.45 
 
 		 483 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  29.89 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  27.6 
 
 		 474 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  28.93 
 
 		 479 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  29.63 
 
 		 483 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  30.74 
 
 		 479 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.37 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  30 
 
 		 472 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  31.5 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  28.32 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  26.89 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.42 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  26.42 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.74 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  24.85 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.46 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  20.2 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  27.67 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  26.4 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  19.54 
 
 		 366 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  27.21 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  23.57 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  28.99 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.28 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  31.18 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  26.06 
 
 		 307 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  23.35 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  22.78 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  27.48 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  32.99 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3533  hypothetical protein  23.86 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>