32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1750 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  100 
 
 		 360 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  35.56 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  34.18 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  27.58 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  26.54 
 
 		 385 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  27.02 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.37 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  26.35 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  26.9 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.13 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.81 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.18 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.24 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  32.83 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.3 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  24.43 
 
 		 483 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  27.7 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  27.68 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  25.77 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  25.38 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  23.75 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  24.72 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  23.37 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  23.45 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  23.37 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  24.14 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  22.69 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.96 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  26.98 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  27.01 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  23.5 
 
 		 517 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  24.88 
 
 		 517 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>