37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2941 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  705    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  52.3 
 
 		 334 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.32 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.35 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.67 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.03 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  29.71 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  29.35 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  26.14 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  27.33 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  28.62 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  27.65 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.84 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  26.46 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.08 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  26.64 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  28.36 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  25 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  23.1 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  22.61 
 
 		 479 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  29.23 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  22.3 
 
 		 483 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  22.26 
 
 		 479 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  22.26 
 
 		 479 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  23.78 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  22.97 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  31.45 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  24.35 
 
 		 479 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  22.4 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  28.26 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15170  predicted P-loop-containing kinase  29.93 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  28.67 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  28.93 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  28.67 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  28.06 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>