27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3248 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  99.04 
 
 		 314 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  93.63 
 
 		 314 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  57.38 
 
 		 307 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  59.93 
 
 		 297 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  53.49 
 
 		 308 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  53.4 
 
 		 334 aa  292  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  49.84 
 
 		 316 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  49.52 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  51.78 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  51.94 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  46.37 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  47.06 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  46.69 
 
 		 346 aa  229  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  44.17 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3215  hypothetical protein  25.17 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1398  hypothetical protein  23.33 
 
 		 719 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.32 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  25.09 
 
 		 366 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.35 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  37.69 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.01 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  26.14 
 
 		 516 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  31.96 
 
 		 391 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>