21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1645 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  754    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  32.89 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.07 
 
 
377 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.93 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.77 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  23.25 
 
 
517 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.08 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  22.93 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  32.31 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  23.17 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  21.51 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  22.35 
 
 
385 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  22.35 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  26.87 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  28.42 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  24.66 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.26 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.26 
 
 
391 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  22.78 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  22.01 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>