43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2154 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1062    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  98.07 
 
 
517 aa  1044    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  28.16 
 
 
375 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  23.7 
 
 
366 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.69 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.91 
 
 
377 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.53 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  23.03 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
461 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  24.09 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  22.82 
 
 
385 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  22.82 
 
 
388 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.89 
 
 
391 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  25.24 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  26.89 
 
 
391 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.6 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  22.69 
 
 
396 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  20.97 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  23.25 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  21.57 
 
 
366 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  22.32 
 
 
391 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  22.75 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  21.72 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  22.69 
 
 
396 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  23.64 
 
 
383 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  23.23 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  24.48 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  22.86 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  24.02 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  24.88 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  21.62 
 
 
316 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  20 
 
 
346 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5558  hypothetical protein  26.02 
 
 
405 aa  47  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  20.2 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  20.7 
 
 
349 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3432  hypothetical protein  37.78 
 
 
441 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  23.67 
 
 
337 aa  44.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  25.95 
 
 
1349 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>