50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1671 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  749    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  33.33 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  36.39 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  34.38 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  33.43 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  34.76 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  35.5 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  33.05 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  34.6 
 
 		 388 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  33.33 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  35.39 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  32.79 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  26.35 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  27.9 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  28.85 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  27.8 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  29.24 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  25.29 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  29.71 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  21 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  28.37 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.72 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  28.37 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  28.37 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  24.37 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  24.37 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  26.5 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  27.33 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  20 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  37.12 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  28.47 
 
 		 346 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  25.29 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  26.16 
 
 		 479 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  26.16 
 
 		 479 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  24.21 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.86 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  31.25 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2507  hypothetical protein  29.83 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0174505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  24.62 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  33.75 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2231  hypothetical protein  31.21 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  24.28 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.29 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  27.33 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1645  hypothetical protein  24.66 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  24.59 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2189  hypothetical protein  30.94 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  30.23 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  24.71 
 
 		 517 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>