51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0951 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  100 
 
 
390 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  69.9 
 
 
391 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  69.13 
 
 
391 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  59.69 
 
 
388 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  59.69 
 
 
385 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  60.21 
 
 
385 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  59.69 
 
 
385 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  56.81 
 
 
388 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  55.18 
 
 
391 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  54.66 
 
 
391 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  51.45 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  34.76 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  34.41 
 
 
337 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  31.6 
 
 
383 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  31.07 
 
 
479 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  30.25 
 
 
479 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  30.25 
 
 
479 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  29.6 
 
 
479 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  29.6 
 
 
479 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  31.41 
 
 
476 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  28.47 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  28.47 
 
 
479 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  29.55 
 
 
483 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  28.46 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  28.05 
 
 
474 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  28.42 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  29.45 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  26.24 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  28.32 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4603  hypothetical protein  27.4 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.920673  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.15 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0156  hypothetical protein  28.67 
 
 
308 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  26.48 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  26.4 
 
 
375 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.24 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.1 
 
 
436 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5619  hypothetical protein  24.66 
 
 
319 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399047  normal  0.171173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2137  hypothetical protein  25.81 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29245  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  27.07 
 
 
429 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  28.92 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1108  hypothetical protein  26.81 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  24.02 
 
 
517 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3552  hypothetical protein  23.66 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.65 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3572  hypothetical protein  27.03 
 
 
314 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  23.11 
 
 
517 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0831  hypothetical protein  31.46 
 
 
297 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3248  hypothetical protein  26.35 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314903  hitchhiker  0.00489305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3444  hypothetical protein  26.35 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  19.89 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  24.54 
 
 
428 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>