29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1669 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  981    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  31.94 
 
 		 483 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  31.81 
 
 		 479 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  32.14 
 
 		 476 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  32.05 
 
 		 483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  31.19 
 
 		 479 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  32.87 
 
 		 479 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  32.87 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  30.98 
 
 		 479 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  31.79 
 
 		 474 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  31.55 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  30.98 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  30.63 
 
 		 385 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  30.28 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  30.28 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  28.14 
 
 		 391 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.49 
 
 		 391 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  26.59 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  30 
 
 		 391 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  30 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  30.45 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.42 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  34.78 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28.47 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  29.24 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  28.52 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  25.69 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.01 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  26.45 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>