28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1599 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  100 
 
 
474 aa  986    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  98.95 
 
 
474 aa  978    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  54.92 
 
 
479 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  54.69 
 
 
479 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  52.14 
 
 
476 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  52.25 
 
 
483 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  50.88 
 
 
479 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  50.54 
 
 
479 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  50.78 
 
 
479 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  49.67 
 
 
483 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  50.44 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  31.75 
 
 
472 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.47 
 
 
391 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.82 
 
 
391 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.6 
 
 
391 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  28.78 
 
 
377 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.24 
 
 
391 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  28.47 
 
 
388 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  28.47 
 
 
385 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  30.77 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  28.1 
 
 
385 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  29.15 
 
 
388 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.05 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.24 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.7 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  28.73 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.68 
 
 
436 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  24.37 
 
 
368 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
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