31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1749 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  51.23 
 
 		 346 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  29.29 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  31.5 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  31.29 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  31.5 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  28.94 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28.68 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.15 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.06 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  29.67 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  29.3 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  28.16 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  29.6 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  25.27 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  25.27 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  25.27 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  26.37 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  25.36 
 
 		 483 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  26.01 
 
 		 479 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  26.01 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  24.55 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  24.54 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  29.21 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  27.15 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  27.78 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4242  hypothetical protein  26.95 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  22.67 
 
 		 474 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  22.67 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  28.81 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  20.44 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>