29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2940 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2940  cell morphology protein  100 
 
 		 377 aa  737    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.659123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  35.45 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  35.82 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  30.2 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  26.87 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  29.87 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.12 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  28.71 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  30.27 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.97 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.89 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  25.85 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.97 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  25.94 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  25.79 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  25.56 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  25.56 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  27.68 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  26.04 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  24.81 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  27.22 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  25.17 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  24.79 
 
 		 479 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  25.76 
 
 		 474 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  24.81 
 
 		 479 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  24.44 
 
 		 483 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  22.78 
 
 		 483 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  28.76 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  21.58 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>