11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0465 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  100 
 
 		 392 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  67.52 
 
 		 388 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3533  hypothetical protein  44.71 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  27.09 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.08 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  22.28 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.17 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  26.37 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  24.78 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
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NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.19 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
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NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  23.21 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
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