12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0266 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0266  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  790    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0465  alginate o-acetyltransferase AlgJ  67.52 
 
 		 392 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0314343  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3533  hypothetical protein  43.09 
 
 		 396 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  29.7 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  27.65 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.12 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  23.57 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  28.48 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  23.02 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  23.16 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  27.33 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  23.08 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
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