25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0232 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0232  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  819    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0635446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1765  hypothetical protein  33.43 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1494  hypothetical protein  33.15 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0843  hypothetical protein  26.14 
 
 
396 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0791  hypothetical protein  26.14 
 
 
396 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0888  hypothetical protein  26.14 
 
 
396 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.112728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0976  hypothetical protein  25.64 
 
 
396 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000233019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0974  hypothetical protein  25.91 
 
 
396 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1066  hypothetical protein  25.64 
 
 
396 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0716  hypothetical protein  25.99 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5558  hypothetical protein  26.94 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  19.6 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  25.29 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3432  hypothetical protein  23.82 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3595  hypothetical protein  26.8 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000806669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.11 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4683  hypothetical protein  26.83 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4314  hypothetical protein  27.44 
 
 
333 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  22.35 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1764  hypothetical protein  29.27 
 
 
101 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14600  hypothetical protein  22.73 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  21.25 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4831  hypothetical protein  24.4 
 
 
334 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.643352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.09 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4197  hypothetical protein  22.47 
 
 
516 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.857934  normal  0.627811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>