19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00760  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  866    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.843515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0052  hypothetical protein  41.69 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1130  alginate O-acetyltransferase AlgJ  26.79 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2847  alginate O-acetyltransferase AlgJ  25.06 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5462  hypothetical protein  24.3 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2128  hypothetical protein  24.48 
 
 		 517 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2154  hypothetical protein  24.48 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.07 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0310  alginate O-acetyltransferase AlgJ  24.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  27.94 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.28 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  26.87 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  26.87 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  24.44 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  28.46 
 
 		 391 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4640  hypothetical protein  28.36 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.191606  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  27.48 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  30.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  26.28 
 
 		 377 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>