42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2665 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  53.26 
 
 		 211 aa  204  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  54.02 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  52.78 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  49.47 
 
 		 208 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  51.04 
 
 		 211 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  45.75 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  50.56 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  51.89 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  46.57 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  50.56 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  50.56 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  55.14 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  47.7 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  47.85 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  42.29 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  40.82 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  37.16 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  52.07 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  59.55 
 
 		 93 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.04 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  40.91 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  41.07 
 
 		 87 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.27 
 
 		 461 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  26.45 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.87 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1658  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  43.14 
 
 		 261 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 		 810 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1454 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 878 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1451 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  30.95 
 
 		 737 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  22.02 
 
 		 272 aa  41.6  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>