37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0648 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  55.56 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  53.4 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  51.2 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  49.53 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  47.17 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  50.56 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  46.39 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  45.67 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  51.69 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  52.76 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50.29 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  48.33 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  58.89 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  57.71 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  57.22 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  47.7 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  36.45 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  39.02 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  42.25 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  43.09 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  55.65 
 
 		 170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  52.17 
 
 		 93 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  22.5 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  44.64 
 
 		 87 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  25.15 
 
 		 296 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  26.12 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0881  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.86 
 
 		 253 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.904873  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.78 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  32.63 
 
 		 261 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>