30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02327 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  59.5 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  53.78 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  50.82 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  56.3 
 
 		 213 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  55.65 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  49.58 
 
 		 215 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  51.72 
 
 		 211 aa  124  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  49.58 
 
 		 211 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  50.81 
 
 		 209 aa  123  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  57.5 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  58.59 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  52.1 
 
 		 213 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  52.14 
 
 		 213 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  52.14 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  51.75 
 
 		 208 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  56.88 
 
 		 219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 209 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  51.38 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  51.09 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  44.63 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  39.81 
 
 		 215 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  40.52 
 
 		 256 aa  86.3  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  43.81 
 
 		 227 aa  84.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  42.24 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 767 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  34.67 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 3172 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0391  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 386 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.46 
 
 		 261 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>