48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2031 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  58.96 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  54.95 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  54.02 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  51.98 
 
 		 213 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  50.48 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  51.2 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  51.49 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  52.69 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  49.74 
 
 		 233 aa  187  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  51.98 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  51.49 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  51.69 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  51.6 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  55.68 
 
 		 238 aa  160  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  53.17 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  41.92 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  45.36 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 209 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  67.39 
 
 		 93 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  40.56 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  38.31 
 
 		 256 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  53.78 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.4 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 275 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  28.33 
 
 		 292 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  34.31 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  31.2 
 
 		 296 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  29.69 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  29.67 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.3 
 
 		 545 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1454 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1451 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 804 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.89 
 
 		 306 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.33 
 
 		 883 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.68 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 750 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.82 
 
 		 634 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.13 
 
 		 1979 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1021  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 324 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 3145 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>