23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1618 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.96 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  91.43 
 
 		 244 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  70 
 
 		 275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  35.07 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  27.21 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  25.9 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  27.33 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  34.83 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0584  hypothetical protein  28.83 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  32.59 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  37.78 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  33.04 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  36.67 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 626 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>