16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4026 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  78.99 
 
 		 268 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  73.54 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  70.61 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  56.64 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  54.9 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  38.39 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  36.49 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5009  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0896  hypothetical protein  29.78 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  35.67 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  28.37 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>