19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0824 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  70.99 
 
 		 268 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  66.79 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  70.61 
 
 		 257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  54.58 
 
 		 280 aa  265  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  51.54 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5009  hypothetical protein  28.91 
 
 		 320 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57640  hypothetical protein  27.99 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0896  hypothetical protein  27.55 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  33.65 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  33.49 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  36.42 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  26.85 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 		 245 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0515  hypothetical protein  28.36 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>