36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0875 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  453  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  44.4 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  44.64 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  28.91 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  34.12 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  33.49 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  34.52 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  36.99 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  29.07 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  31.14 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  30.39 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  28.83 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0580  tetratricopeptide domain-containing protein  31.54 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.367595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  28.26 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0515  hypothetical protein  30.97 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0275  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00217035  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  29.55 
 
 		 406 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  27.67 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 716 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 878 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.96 
 
 		 810 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  25.78 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 		 406 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 		 373 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 		 406 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 556 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 534 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.29 
 
 		 624 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 750 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 587 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.84 
 
 		 564 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>