30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1141 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  559  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  52.65 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  41.81 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  29.74 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  30.91 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  28.91 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  26.74 
 
 		 406 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 667 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 620 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 583 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  30.34 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 762 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  30.15 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 878 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  27.21 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.02 
 
 		 639 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.29 
 
 		 603 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.86 
 
 		 620 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.09 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.27 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 468 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 568 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  29.37 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>