50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1939 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1939  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0648  hypothetical protein  54.46 
 
 
224 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3310  hypothetical protein  58.42 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.628665  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3020  hypothetical protein  56.44 
 
 
213 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.621257  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2665  hypothetical protein  53.54 
 
 
209 aa  204  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0845681  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003616  hypothetical protein  52.74 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2031  TPR repeat-containing protein  55.21 
 
 
206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3946  TPR repeat-containing protein  52.46 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2712  hypothetical protein  56.93 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160555  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3040  hypothetical protein  56.44 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338752  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03396  TPR repeats containing protein  49.48 
 
 
233 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0293  hypothetical protein  66.06 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.545966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0950  TPR repeat-containing protein  51.32 
 
 
215 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265468  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4142  TPR repeat-containing protein  51.96 
 
 
208 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3832  TPR repeat-containing protein  49.21 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.172551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3353  hypothetical protein  59.09 
 
 
214 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2433  hypothetical protein  51.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28641  normal  0.541906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2843  hypothetical protein  44.95 
 
 
256 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2596  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 
209 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03397  TPR repeats containing protein  40.51 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1283  TPR repeat-containing protein  43.01 
 
 
230 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2557  hypothetical protein  45 
 
 
227 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02327  TPR repeat-containing protein  59.5 
 
 
170 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0734856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0138  hypothetical protein  62.64 
 
 
93 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.299058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1528  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336716  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  29.41 
 
 
273 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 
245 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1015  hypothetical protein  35.56 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1166  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.62 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2878  hypothetical protein  28.07 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  29.76 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
699 aa  48.5  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1452  hypothetical protein  29.67 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  36.05 
 
 
306 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
804 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1829  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725463  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2610  tetratricopeptide TPR_2  31.62 
 
 
269 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104861  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02328  TPR repeats containing protein  45.28 
 
 
87 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.090455  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33 
 
 
295 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 
773 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1522  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.33 
 
 
280 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  35.04 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1168  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.75 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1088  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.75 
 
 
275 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.756407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0851  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  37.38 
 
 
255 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>